1、提交商标申请
直接向欧盟知识产权局申请分为在线申请和纸质申请，在线申请费用更低且只需使用一种语言。欧盟知识产权局还有快速申请渠道，可以加快欧盟知识产权局审查进程，尽快公开注册申请。
2、商标审查
收到申请后，欧盟知识产权局将进行审查，发现问题将通知申请人在2个月内补正。未能在规定时间内补正的，欧盟知识产权局将全部或部分驳回申请或主张。
不服欧盟知识产权局决定的，可上诉至欧盟知识产权局内部的上诉委员会，不服上诉委员会决定的，可以上诉至欧盟普通法院，欧盟普通法院的判决还可以上诉至欧盟司法法院。
但欧盟知识产权局在审查商标注册申请时并不主动审查是否存在在先权利，在先权利人可以通过异议、请求宣告无效等程序来维护自己的权利。
3、公开申请以及异议
欧盟知识产权局审查不存在问题的，注册申请将被公开在欧盟商标公报上。
任何人认为申请注册的商标损害其在先权利的，可以在申请公开1个月后的3个月内提出异议，欧盟知识产权局将组织双方程序并将最终做出决定。不服欧盟知识产权局最终决定的，可以按照上段步骤进行上诉。任何人认为申请注册的商标不符合商标注册条件的，可以向欧盟知识产权局提出意见，提出意见不用付费，欧盟知识产权局将告知申请人，并予以考虑。
4、注册及公开
如果在规定时间内无人提出异议或意见或，或者异议或意见不成立的，欧盟知识产权局将进行注册、在欧盟商标公报上公开并发给电子注册证。
欧盟商标注册后5年内必须投入使用，否则任何人均可对其提出不使用撤销注册申请。任何人还可以向欧盟知识产权局申请撤销注册商标或宣告注册商标无效。不服欧盟知识产权局最终决定的，也可以按照上段步骤进行上诉。欧盟注册商标转让或许可他人使用的，应当在欧盟知识产权局备案。