1、欧盟商标注册对商标的显著性要求很高，共同体27个成员国中只要一个成员国有人提出异议，且异议成立，将导致整个共同体商标注册被驳回。尽管该驳回商标可以转换为国家申请，且保留原共同体商标申请日，但申请人还须支付向每个国家的转换费用。因此，若选用商标的显著性不是很强，则不适合申请共同体商标注册。
2、 在内部市场协调局申请共同体商标注册的时间较难确定，如果一切顺利，商标可能在6-12个月内获得注册。然而，只要有一个国家提出异议，该商标就不能及时得到注册，解决异议需花费很长的时间，通常需2年左右时间。